华大基因:研发新冠变异株B.1.1.7试剂盒 1小时鉴别
原标题:华大基因:研发新冠变异株B.1.1.7试剂盒,1小时鉴别
由英国率先报告的新冠突变毒株B.1.1.7谱系已向多国蔓延,这引发了外界对疫情的进一步关注。
1月5日,国内基因测序上市公司深圳华大基因股份有限公司(下称“华大基因”,300676)控股子公司深圳华大因源医药科技有限公司(下称“华大因源”)宣布,公司研发了新型冠状病毒SARS-CoV-2 B.1.1.7株(N501Y)快速鉴定试剂盒。
华大因源称,针对新型冠状病毒检测阳性的病例,可进一步进行B.1.1.7型主要突变位点N501Y的快速鉴别诊断,一个小时内完成。
据介绍,该试剂盒采用ARMS-qPCR方法,针对英国B.1.1.7株核心突变位点N501Y设计特异性扩增,结合荧光探针信号,快速识别野生型和突变型病毒株,可实现野生型病毒株(501N)和突变型病毒株(501Y)的鉴别诊断。
此前的2020年12月14日,英国率先向世卫组织(WHO)通报出现新的B.1.1.7新冠病毒株。
根据爱丁堡大学的Andrew Rambaut、伯明翰大学的Nick Loman、格拉斯哥大学病毒研究中心David L Robertson等10位科学家代表英国COVID-19基因组学联盟(CoG-UK)在病毒学网站(virological.org)上传的新突变株序列及相关分析和结论,最早的2个B.1.1.7谱系的基因组样本于2020年9月20日在肯特郡采集,另一个于2020年9月21日在大伦敦采集。
这10位科学家提到,B.1.1.7谱系是在D614G突变株基础上发生突变,但其携带异常多的病毒基因变化。该毒株有23个特殊的突变,包括14个非同义突变(氨基酸改变)、3个缺失,此外还有6个同义突变(非氨基酸改变)。这是迄今为止首次在一个毒株上出现如此多的变异。
其中3个突变具有潜在的生物学效应,这些效应之前也被描述过。第一个即是N501Y突变,N501Y是受体结合域(RBD)内6个关键接触残基之一,已被鉴定为增加与人和鼠ACE2的结合亲和力。科学家也据此推测,B.1.1.7毒株传染性提高70%,极有可能与N501Y突变有关。
世卫组织在一份通报中指出,虽然初步评估显示B.1.1.7新冠病毒株不会增加疾病严重性,但其会导致更高的发病率,产生更多住院及死亡病例,所以需要采取更严格的公共卫生措施来控制这些变异病毒的传播。世卫组织建议各国增加对新冠病毒的监测,以更好地了解病毒传播并监测变体。
值得注意的是,1月1日,上海市疾控中心发布消息称,中心近日对英国输入的新冠肺炎确诊病例进行基因组测序,发现1例病例的新冠病毒基因序列与近期英国报道的变异病毒基因相似。
香港卫生署1月2日通报,截至1月2日凌晨零时,经辖下公立化验所的化验分析,累计发现10例输入病例的病毒基因排序与英国发现的变异新冠病毒株吻合,2例与南非发现的变异新冠病毒株吻合。
1月3日,广东省疾控中心宣布,1月2日,该疾控中心在一名英国输入新冠肺炎确认病例的咽拭子样本中发现了B.1.1.7突变株,与近期英国报道的变异病毒基因序列高度相似。
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