美媒:美国新冠病毒基因测序落后 许多数据来自几月前

原标题：美媒：美国新冠病毒基因测序落后，许多数据来自几个月前

（观察者网 讯）新冠疫情在美国暴发以来，特朗普政府各应对措施广受批评。近期，变异新冠病毒病例出现在美国后，美媒注意到国内疫情应对的又一大缺陷——病毒基因测序。

美国有线电视网（CNN）1月11日撰文指出，根据病毒数据库GISAID，美国不论是在病毒基因测序的比例上，还是速度上，都落后于很多国家。许多医疗资源落后于美国的国家，如孟加拉、苏里南和斯里兰卡，处理病毒样本的速度都比美国快。

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对此，医学专家认为这“很可悲”，并可能造成新病毒变种在人群中的广泛传播，政府却对此毫不知情。并且，专家们还担心，这可能造成疫苗失效。

样本处理速度上，美国低于苏里南

GISAID数据显示，在从患者身上收集、分析并发布病毒样本的速度方面，美国需要85天，排名世界第61位。许多医疗资源少得多的国家，包括孟加拉国、斯里兰卡和苏里南，处理样本的速度比美国快。

对于美国病毒基因测序方面的落后，贝勒医学院（Baylor College of Medicine）病毒学家彼得·霍特兹（Peter Hotez）博士说：“这很可悲。当你需要等待85天的时候，一个基因序列可能已经从一种罕见的变异，变成在一半人群中流行的病毒。”

美国疾控中心流感部前主任南希·考克斯（Nancy Cox）也表示：“当许多国家都在做得更好，明显更好时，我认为这告诉我们，美国应该齐心协力。”

疾控中心先进分子检测办公室主任格雷戈里·阿姆斯特朗（Gregory Armstrong）博士则辩解说，GISAID上的数据有延后，因此具有“误导性”，但他也承认美国在病毒基因测序上“仍需改进”。

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阿姆斯特朗解释说，在美国，疾控中心的实验室、国家卫生部门、私人公司和大学都在向GISAID提交序列。“当然，这并不意味着检测周转时间（TAT，指标本采集到实验室接收标本的时间）不重要。”

但CNN指出，美国在病毒基因测序上为人诟病，并不仅仅是因为时间上的拖延。考虑到病毒在美国的“猖獗程度”，美国基因测序的案例实在太少。

根据GISAID数据，美国已经绘制并发布了近7万名新冠病毒感染的样本，这一数字仅次于英国的15万。然而，美国的新冠病例比其他任何国家都多，目前已超过2200万例，远超世界其他国家。

因此，从测序数量的比例来看，美国出现了不足。根据GISAID数据，美国每1000例病例内，只公布2.8个基因序列，落后于34个国家。从绝对比例来看，美国基因测序的病例，只占总病例的约0.3%，排名世界第43位。

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GISAID最新数据综合排名：美国每千病例的测序病例为2.78人，检测时间中位数为84天

去年年底，美国每周大约对3000个样本进行测序。今年年初，美国疾病控制与预防中心制定了一个目标，在两周内，美国实验室发布的样本数量应该增加到每周6500个。

阿姆斯特朗说，1月2日至8日的那一周，美国的实验室进行了10619份样本的测序，但其中只有1001份，于过去4周内采集。

对此，考克斯悲观地表示：“难道我们必须要在所有有关新冠肺炎疫情的事中垫底，或接近垫底吗？我知道我们本可以做得更好，但却没有做得更好，这真的很令人沮丧。”

专家：基因测序是关键，可能影响疫苗

哈佛大学公共卫生教授威廉·哈瑟丁（William Haseltine）1月8日在福布斯上撰文指出，基因测序是识别病毒变异的关键，若测序不力，无法识别出新的毒株，那么不仅前景可怕，疫苗的使用和推广也会受到影响。

哈瑟丁科普称，基因组测序本质能够获取DNA分子化学的碱基顺序。科学家利用这些序列来识别基因、监控指令，而在新冠病毒的案例下，能够识别病毒突变。本次疫情早期的测序工作，帮助科学家们确定了病毒的结构，让人们意识到这种病毒具有足够的传染性。而近期，测序工作也帮助人们识别了英国和南非出现的两种变异病毒。

近一年来，新冠基因组学盟（Covid-19 Genomics Consortium）一直在跟踪病毒的变化，记录了超过15万个病毒样本。

但是在美国，基因测序工作却非常滞后。美国已经出现来自英国和南非的新毒株，这种传播性表明，涉及这些变异病毒的病例已经非常普遍。但美国缺乏基因组测序，使得变异逃避监控。

哈瑟丁指出，病毒在每次传播到新的宿主时都可能发生变异。全世界有数千万的记录病例，因此可能还有隐藏的新毒株没有被发现。一些估计显示，仅在美国，就有15-20%的美国人感染了新冠病毒，这使得美国病例衍生出一种新的变种，成为可能的情况。如果本土变异存在的话，这可能有助于解释最近在假日季节观察到的新冠病例激增。

一种更具传染性的毒株在美国蔓延的前景已经够可怕的了，但如果有足够多的变异，一种毒株可能会使目前的疫苗无效，这就是为什么必须加强寻找这些新毒株努力。如果部分人群具有新冠疫苗耐药株，国家公共卫生机构就必须识别他们，并在此基础上继续疫苗研究。

最后，哈瑟丁表示，疫苗分发目前已开始推进，生活可能将在2021年恢复正常，但相反的情况也可能发生。美国和全世界都必须加强病毒基因的测序，识别和分离新毒株。否则，人类依旧将面临非常漫长的一年。

责任编辑：赖柳华 SN244